Quels sont les objectifs du projet ? Quels outils ont été développés ?
Réponses en vidéo par Marion THELLIER chargée de projet de l’Atlas au sein du Laboratoire BOREA avec Patrice Pruvost, au Muséum national d’Histoire naturelle à Paris, en collaboration avec Office français de la biodiversité et INPN / PatriNat (OFB – MNHN – CNRS – IRD).
Marion Thellier nous a présenté l’état d’avancement du projet lors d’un séminaire Laboratoire BOREA qui s’est tenu en présentiel au MNHN et en visio.
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Quel est l’objectif de ce projet ?
La liste des poissons marins de France métropolitaine comprend actuellement 763 espèces, reflétant la richesse de la biodiversité des eaux françaises. L’objectif du projet est de mettre à disposition un outil de référence, nécessaire à l’évaluation de l’état de la biodiversité non seulement pour la gestion et la préservation, mais également à des fins de dissémination des connaissances scientifiques, auprès du grand public, des associations environnementales, des professionnels de la pêche, des administrations et gestionnaires de l’environnement et des scientifiques.
Quels outils ont été développés ?
Ce projet a été l’occasion de développer des outils sous Excel, R et RShiny, pour générer automatiquement des fiches espèces à partir des données de FishBase et de fournir des cartes de distribution à partir de multiples jeux de données d’occurrence. Ces outils comprennent des instructions précises et un lexique pour harmoniser les retours, ainsi qu’une application en ligne permettant aux experts de consulter les données d’occurrence des espèces et de signaler les points à corriger. La mise en place d’outils de validation par les experts permet un processus itératif de correction des données et d’enrichissement des bases de connaissance. Ces outils pourraient à terme être déployés pour générer automatiquement d’autres fiches espèces à partir de FishBase ou de SealifeBase. À ce jour, 523 espèces sont en cours d’analyse, avec la collaboration active de 27 experts, nationaux et internationaux.